Contributions to metabolic network : Reconstructions

Abstract

Esta tesis presenta contribuciones para la reconstrucción a escala del genoma de las redes metabólicas y sus restricciones basadas en análisis. Se presenta una breve descripción general del modelado y la reconstrucción de redes metabólicas. presentado en el primer capítulo. El capítulo 2 presenta un flujo de trabajo destinado a ayudar al genoma Reconstrucción a escala de redes metabólicas, asegurando que el proceso esté documentado y reproducible. El Capítulo 3 escribe la aplicación de la reconstrucción y el análisis de redes de genoma-escala en el estudio de P. salmonis, una bacteria patógena de peces que actualmente es una gran amenaza para la industria del cultivo del salmón. Se presenta una reconstrucción completa de la red metabólica de P. salmonis y se compara con las redes de otras bacterias patógenas que revelan las particularidades del metabolismo del patógeno de los peces. Además, a través del análisis de su red, se obtienen los metabolitos esenciales necesarios para su crecimiento. Identificada, información que pueda orientar su cultura eficiente y facilitar su estudio. En el capítulo 4 se reconstruyen las redes metabólicas de dos bacterias adicionales aisladas de los entornos de biolixiviación.